Los vectores YPR son independientes, circulares y tiene capacidad de autorreplicación debido a que llevan incorporado un origen de replicación. La frecuencia de transformación es de 103 ó 104 por μg de ADN, aunque es poco estable en mitosis y meiosis. La célula hija suele perderlo y la célula madre tiende a acumularlo. Solo aparece el plasmido en el 5% de la población siendo poco eficaz.
Los vectores YCP son muy parecidos a YRP, pero si diferencia en que presenta un centrómero. Son minicromosomas. Gracias a la secuencia Cen segregan 1:1 en mitosis y 2:2 en meiosis. No suele haber más de una copia por célula. Se suele perder en una frecuencia del 1% por generación. Hay varios cortes que producen diferentes integraciones, pero lo más normal es cortar en secuencias únicas.
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